Sejak 1990an pembantaian besar-besaran yang dilakukan oleh militer Indonesia di Timor-Timur menggunakan senjata yang dibeli dari pemerintah asing, darisana diketahui bahwa pemerintah asing telah melatih dan mempersenjatai militer Indonesia serta ikut terlibat dalam berbagai aksi.

Hingga tahun 1990an, Pemerintah Amerika Serikat kemudian menjatuhkan sangsi berupa embargo perlengkapan militer bagi Indonesia, dan menghentikan pendidikan militer serta berbagai kerjasama lainnya terkait bidang militer.

Namun pemerintah Inggris tetap meneruskan pengiriman suku cadang dan peralatan yang disebut "tidak mematikan" dimana pada waktu yang sama mereka juga mengutuk penggunaan pesawat jet Hawk yang digunakan untuk melakukan pemboman, apa yang disebut oleh militer Indonesia sebagai penyerangan terhadap pemberontak; bahkan tank Scorpion buatan Inggris itu juga digunakan untuk melakukan penyisiran di kota-kota dan desa-desa, dimana sebagian besar yang menjadi korban adalah masyarakat sipil. Meskipun konflik telah berlangsung bertahun-tahun, pemerintah Indonesia lebih memilih untuk tidak menanggapi permintaan Pemerintah Inggris agar persenjataan itu tidak digunakan dalam operasi di Aceh - juga di wilayah nusantara lainnya.

Setelah perdebatan hebat di Amerika Serikat, embargo senjata akhirnya dihentikan - pemerintah dan pihak militer Amerika Serikat kini terjalin dengan militer Indonesia. Bahkan Inggris dan Australia pun ikut dalam pendidikan serta latihan bersama untuk mendorong pembaharuan.